Description : En février dernier, les éditeurs de la revue PLOS Biology ont publié un éditorial expliquant les raisons pour lesquelles ils mettent en place une nouvelle politique obligatoire de partage du code.
Ils partent du constat que la grande majorité des recherches en biologie s’appuient sur du code : il peut s’agir de l’élément central du projet, de code utilisé pour le nettoyage, l’analyse, ou la visualisation des données, ou encore de petits scripts permettant d’exécuter des progiciels prêts à l’emploi. Dans tous les cas, il y a de fortes chances pour que les articles contiennent du code.
Depuis trois ans, PLOS Biology demande aux auteurs des articles acceptés de partager leur code publiquement. Pourtant, la revue a constaté un écart entre les articles liés à une recherche produisant du code et les articles qui partagent du code. Selon eux, les obstacles seraient notamment une compréhension incomplète de ce qui doit être partagé et une méconnaissance des exigences en matière de code. C’est la raison pour laquelle la revue a décidé de formaliser ses exigences dans une nouvelle politique. Accompagnée d’un guide, celle-ci clarifie ce qui doit être partagé et fournit des directives détaillées sur la méthodologie à suivre.